Prof. Dr. Uwe Ohler
Profil
Zusammenfassung
Uwe Ohler entwickelt Methoden zur Analyse von Genregulation auf genomischer Ebene, insbesondere zur Kartierung von Genexpression in Raum und Zeit sowie zur Identifikation von RNA-Protein-Wechselwirkungen. Seine Expertise verbindet Hochdurchsatz-Sequenzierungstechniken mit Bioinformatik und maschinellem Lernen, um regulatorische Netzwerke in Pflanzen und anderen Organismen zu entschlüsseln.
Skills
Stammdaten
Identität, Organisation und Kontakt aus HU-FIS.
- Name
- Prof. Dr. Uwe Ohler
- Titel
- Prof. Dr.
- Fakultät
- Lebenswissenschaftliche Fakultät
- Institut
- Institut für Biologie
- Arbeitsgruppe
- Systems Biology of Gene Regulation (S)
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- Telefon
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- HU-FIS-Profil
- Quelle ↗
- Zuletzt gescrapt
- 27.6.2026, 01:11:49
Forschungsthemen4
IGRK 2403/1: Analyse und Umbau des regulatorischen Genoms
Quelle ↗Förderer: DFG Graduiertenkolleg Zeitraum: 01/2019 - 12/2023 Projektleitung: Prof. Dr. Uwe Ohler
IGRK 2403: Analyse und Umbau des regulatorischen Genoms
Quelle ↗Förderer: DFG Graduiertenkolleg Zeitraum: 01/2019 - 12/2024 Projektleitung: Prof. Dr. Uwe Ohler
SFB/TRR 175/1: Von prädikativen zu mechanistischen Modellen der plastidären Genexpression mittels Hochdurchsatz-Sequenzdaten (TP D01)
Quelle ↗Förderer: DFG Sonderforschungsbereich Zeitraum: 07/2016 - 06/2021 Projektleitung: Prof. Dr. Uwe Ohler
Mögliche Industrie-Partner280
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Publikationen25
Top 25 nach Zitationen — Quelle: OpenAlex (BAAI/bge-m3 embedded für Matching).
Science · 1194 Zitationen · DOI
Transcriptional programs that regulate development are exquisitely controlled in space and time. Elucidating these programs that underlie development is essential to understanding the acquisition of cell and tissue identity. We present microarray expression profiles of a high-resolution set of developmental time points within a single Arabidopsis root and a comprehensive map of nearly all root cell types. These cell type-specific transcriptional signatures often predict previously unknown cellular functions. A computational pipeline identified dominant expression patterns that demonstrate transcriptional similarity between disparate cell types. Dominant expression patterns along the root's longitudinal axis do not strictly correlate with previously defined developmental zones, and in many cases, we observed expression fluctuation along this axis. Both robust co-regulation of gene expression and potential phasing of gene expression were identified between individual roots. Methods that combine these profiles demonstrate transcriptionally rich and complex programs that define Arabidopsis root development in both space and time.
Nature · 728 Zitationen · DOI
Molecular Cell · 668 Zitationen · DOI
Kooperationen7
Bestätigte Forscher↔Partner-Paare aus HU-FIS — Gold-Standard-Positive für das Matching.
IGRK 2403/1: Analyse und Umbau des regulatorischen Genoms
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IGRK 2403/1: Analyse und Umbau des regulatorischen Genoms
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SFB/TRR 175/1: Von prädikativen zu mechanistischen Modellen der plastidären Genexpression mittels Hochdurchsatz-Sequenzdaten (TP D01)
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